A empresa responsável pela gestão ambiental promove a execução de programas ambientais para monitoramento dos impactos que podem ocorrer durante a construção da ponte. Dentre os eles, já está em execução o Programa de Monitoramento da Qualidade da Água (PMQA), que realiza coleta mensais em oito pontos, sendo seis no Rio Araguaia e dois em rios afluentes. Essas amostras são analisadas e o resultado de cada parâmetro é comparado com a legislação ambiental para avaliação da qualidade da água antes e durante as obras.